Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms