Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms