Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms