Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta2P62737 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta2P62737 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms