Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpfP62307 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms