Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ythdf1P59326 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms