Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms