Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms