Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms