Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TspoP50637 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TspoP50637 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TspoP50637 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms