Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rplp1P47955 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rplp1P47955 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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