Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms