Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms