Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms