Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms