Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms