Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18528 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18528 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18528 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18528 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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