Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms