Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms