Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms