Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms