Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntfrO88507 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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