Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cfdp1O88271 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfdp1O88271 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms