Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms