Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgceO70258 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgceO70258 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgceO70258 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgceO70258 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgceO70258 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgceO70258 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgceO70258 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgceO70258 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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