Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HcrtO55241 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms