Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChkbO55229 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChkbO55229 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms