Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx4O55187 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms