Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2a2O55143 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms