Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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