Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms