Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb3O54890 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms