Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmbrO54799 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmbrO54799 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms