Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek2O35942 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nek2O35942 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms