Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1mwO35599 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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