Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms