Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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