Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm2888K7N746 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2888K7N746 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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