Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr92-203ENSMUST00000216341 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm21887J3QQ04 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms