Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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