Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm21788J3QNH3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm21788J3QNH3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm21788J3QNH3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm21788J3QNH3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21788J3QNH3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm21788J3QNH3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Gm21788J3QNH3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21788J3QNH3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21788J3QNH3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21788J3QNH3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21788J3QNH3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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