Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r34G3XA52 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r34G3XA52 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms