Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms