Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf4E9QAP7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms