Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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