Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms