Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsf1E9PWW9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsf1E9PWW9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms