Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU018091E9PWS4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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AU018091E9PWS4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms