Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3002E9PW72 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms