Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms